حضرت آیة الله علامه سید محمد حسین حسینی طهرانی در سال 1345 قمری در تهران دیده به جهان گشود؛ پدر ایشان مرحوم آیة الله حاج سید محمد صادق كه از شاگردان آیة الله میرزا محمد تقی شیرازی و هم بحث مرحوم آیة الله سید عبدالهادی شیرازی، انسانی بصیر و غیور و حافظ فرهنگ الهی و سنت نبوی و شئونات اصیل اسلام و از بارزین در حفظ تدین در برابر دستگاه رضا خان پهلوی بوده یكی از چهار عالم سرشناس تهران به شمار می رفت.
سید محمد حسین با سرپرستی پدر، دوران تحصیلات ابتدائی و متوسطه خود را در رشته مكانیك و ماشین سازی سپری نمود. پس از اتمام تحصیلات با وجود پیشنهادات بسیار برای ادامه تحصیل در خارج و پذیرش مسئولیتهای گوناگون در رشته تخصصی، با استمداد از قرآن، تحصیل علوم توحیدی و قرآنی را انتخاب نموده، راه طلبگی را پیش گرفت و به دست مرحوم آیة الله میرزا محمد طهرانی صاحب «مستدرك البحار» كه از اعاظم عصر و دائی پدری او بود، در مشهد مقدس مخلع به لباس تقوی و علم گردید.