مرحوم آیة اللّة حاج سید محمد محقق داماد به سال 1325ه.ق در خانواده ای روحانی - كه به تقوا اشتهار داشتند - در احمد آباد اردكان به دنیا آمد.

پدر بزرگوارش روحانی مخلص به نام سید جعفر موسوی از علاقمندان واقعی خاندان پیامبر (ص) بود. او قبل از تولد محقق داماد به زیارت عتبات عالیات با پای پیاده از وطن خود خارج شد و در همین سفر روح پاكش به ملكوت اعلی پیوست. او كه قبل از ولادت پدر را از دست داده بود در شش سالگی مادر نیز از دست داد.

حاج سید محمد پس از تحصیل علوم مقدماتی در اردكان راهی شهر یزد شد و از محضر استادان بزرگ آن زمان در یزد كسب فیض نمود.