پژوهشكده لیزر در سال 1372 در دانشكده علوم فعالیت خود را آغاز نمود. در سال 74 این پژوهشكده مجوز اصولی و در سال 1377 مجوز قطعی تأسیس خود را از شورای گسترش وزارت علوم، تحقیقات و فناوری دریافت نمود و در سال 1383 به دنبال گسترش فعالیتها، به پژوهشكده لیزر و پلاسما تغییر نام یافت.
اولین دوره كارشناسی ارشد فوتونیك در سال 81 در پژوهشكده راه اندازی شد. دوره دكتری فوتونیك در سال 1383 و كارشناسی ارشد مهندسی پلاسما نیز در سال 1384 شروع به فعالیت و جذب دانشجو نمودند. آمار دانشجویان
این دوره ها به منظور فعالیت حرفه ای و دقیق علمی در موضوعات مرتبط ایجاد شده اند و فارغ التحصیلان غالبا" به ادامه تحصیل پرداخته و یا در مجموعه های مختلف تخصصی مرتبط مشغول به كار شده اند.
هدف اصلی این پژوهشكده گسترش علم لیزر، اپتیك، فوتونیك و پلاسما با تربیت نیروی متخصص، انجام تحقیقات پایه ای جهت گسترش مرزهای علم و تحقیقات كاربردی در صنعت و علوم، می باشد.
در حال حاضر 5 گروه پژوهشی مصوب زیر در پژوهشكده لیزر و پلاسما وجود دارد:
1- كاربردهای لیزر
2- تكنولوژی لیزر
3- ماده چگال
4- بیوفوتونیك
5- مهندسی پلاسما
همچنین این پژوهشكده شامل 18 آزمایشگاه فعال می باشد.
1. آزمایشگاه ادوات فعال نوری
2. آزمایشگاه پلاسما
3. آزمایشگاه طیف سنجی لیزری
4. آزمایشگاه فوتونیك مواد آلی و پلیمرها
5. آزمایشگاه لیزرهای گازی
6. آزمایشگاه مگنتو فوتونیك
7. آزمایشگاه نانو مغناطیس و نیمرساناهای مغناطیسی
8. گروه بیوفوتونیك
8.
هم اكنون تعداد 16 عضو هیأت علمی در پژوهشكده فعالیت دارند.