عالی ترین مرجع سیاستگذاری مركز اسناد انقلاب اسلامی هیات امنای آن می باشد.
اعضای آن عبارتند از آقایان: حجت الاسلام والمسلمین مصطفی پورمحمدی(رئیس هیات امنا)، حجت الاسلام سید حمید روحانی و حجت الاسلام روح الله حسینیان