او در سال 1330 هجری قمری در 20 سالگی راهی حوزه علمیه نجف گردید و در آن دیار نیز آنچه كه در توان داشت برای رسیدن به منزلت عالی علمی و معنوی به كار گرفت. مدت اقامت وی در حوزه علمیه نجف 20 سال طول كشید.

او در این مدت دوره های تحصیل را در علوم مختلف به پایان رسانده و در اواخر در حوزه نجف شاهد مجلس درس باشكوه شیخ انصاری و میرزای شیرازی بوده است.

ایشان از بزرگانی چون شیخ الشریعه اصفهانی، حاج میرزا حسن نائینی، سید ابو الحسن اصفهانی، سید محمد فیروز آبادی، حاج شیخ عبدالكریم حائری و شیخ ضیاء الدین عراقی اجازه اجتهاد و اجازه نقل روایت داشتند.[i]  

آیت الله حجت در سال 1349 هجری قمری به جهت بیماری و ناراحتی های جسمی به ایران باز می گردد. [ii]