این مركز پایان نامه هایی با محوریت آراء شهید مطهری ارائه كرده است كه به بعض این پایان نامه ها اشاره می شود:
· بررسى كاركردهای اجتماعی دین در اندیشه عالمان شیعی معاصر (امام خمینی (ره)-علامه طباطبایى-مرتضى مطهرى-على شریعتی)
· نقدى بر كتاب "اگزیستانسیالیسم و اصالت بشر" اثر ژان پل سارتر از دیدگاه استاد مطهری(ره)
· بررسى نظرات استاد شهید مطهری در تفسیر و علوم قرآن
· رابطه ایمان و عقلانیت از دیدگاه توماس آكویناس، سورن كی یركگور، ویلیام جیمز، علامه طباطبائي و استاد مرتضى مطهرى
· بررسى و نقد مباني معرفت شناختى، انسان شناختی و اخلاقی اومانیسم با تاكید بر آرای علامه طباطبائی و شهید مطهرى
· توجیه اعتقاد دینی از طریق عقل عملی " از دیدگاه پاسكال، ویلیام جیمز و شهيد مطهرى"